Running examples in ‘netmeta-Ex.R’ failed
The error most likely occurred in:

> base::assign(".ptime", proc.time(), pos = "CheckExEnv")
> ### Name: hasse
> ### Title: Hasse diagram
> ### Aliases: hasse
> ### Keywords: Hasse diagram hplot
> 
> ### ** Examples
> 
> # Use depression dataset
> #
> data(Linde2015)
> #
> # Define order of treatments
> #
> trts <- c("TCA", "SSRI", "SNRI", "NRI",
+           "Low-dose SARI", "NaSSa", "rMAO-A", "Hypericum",
+           "Placebo")
> #
> # Outcome labels
> #
> outcomes <- c("Early response", "Early remission")
> #
> # (1) Early response
> #
> p1 <- pairwise(treat = list(treatment1, treatment2, treatment3),
+                event = list(resp1, resp2, resp3),
+                n = list(n1, n2, n3),
+                studlab = id, data = Linde2015, sm = "OR")
Warning: Comparisons with missing TE / seTE or zero seTE will not be considered in network meta-analysis.
Comparisons will not be considered in network meta-analysis:
 TE seTE studlab treat1  treat2 event1  n1 event2  n2 incr allstudies  id
 NA   NA      14    TCA    SSRI     NA  10     NA  11    0      FALSE  14
 NA   NA      18    TCA Placebo     NA  73     NA  73    0      FALSE  18
 NA   NA      21    TCA  rMAO-A     NA  46     NA  98    0      FALSE  21
 NA   NA      27   SSRI Placebo     NA  80     NA  81    0      FALSE  27
 NA   NA      51    TCA  rMAO-A     NA  71     NA  71    0      FALSE  51
 NA   NA     130    TCA   NaSSa     NA  35     NA  36    0      FALSE 130
 NA   NA     131   SSRI    SNRI     NA 697     NA 688    0      FALSE 131
 NA   NA     130    TCA Placebo     NA  35     NA  34    0      FALSE 130
 NA   NA     130  NaSSa Placebo     NA  36     NA  34    0      FALSE 130
           author year treatment1 treatment2 treatment3 n1.orig resp1 remi1
 Barge-Schaapveld 1995        TCA       SSRI                 10    NA    NA
     Boyer Teil 2 1996        TCA    Placebo                 73    NA    NA
         Wheatley 1992        TCA     rMAO-A                 46    NA    12
          Barrett 2001       SSRI    Placebo                 80    NA    45
   Kragh-Sorensen 1995        TCA     rMAO-A                 71    NA    25
           Murphy 1976        TCA      NaSSa    Placebo      35    NA    NA
            Thase 2011       SSRI       SNRI                697    NA   165
           Murphy 1976        TCA      NaSSa    Placebo      35    NA    NA
           Murphy 1976        TCA      NaSSa    Placebo      35    NA    NA
 loss1 loss.ae1 ae1 n2.orig resp2 remi2 loss2 loss.ae2 ae2 n3 resp3 remi3 loss3
    NA        0   5      11    NA    NA    NA        0   3 NA    NA    NA    NA
    33       17  63      73    NA    NA    35        2  43 NA    NA    NA    NA
    12        5  18      98    NA    29    19        3  25 NA    NA    NA    NA
    20        6  NA      81    NA    37    14        0  NA NA    NA    NA    NA
    28       21  NA      71    NA    36    13        4  NA NA    NA    NA    NA
     8       NA  NA      36    NA    NA     5       NA  NA 34    NA    NA     6
   348       82 547     688    NA   200   327      104 534 NA    NA    NA    NA
     8       NA  NA      36    NA    NA     5       NA  NA 34    NA    NA     6
     8       NA  NA      36    NA    NA     5       NA  NA 34    NA    NA     6
 loss.ae3 ae3
       NA  NA
       NA  NA
       NA  NA
       NA  NA
       NA  NA
       NA  NA
       NA  NA
       NA  NA
       NA  NA
> #
> net1 <- netmeta(p1,
+                 comb.fixed = FALSE, comb.random = TRUE,
+                 seq = trts, ref = "Placebo")
Warning: Comparisons with missing TE / seTE or zero seTE not considered in network meta-analysis.
Comparisons not considered in network meta-analysis:
 studlab treat1  treat2 TE seTE
      14    TCA    SSRI NA   NA
      18    TCA Placebo NA   NA
      21    TCA  rMAO-A NA   NA
      27   SSRI Placebo NA   NA
      51    TCA  rMAO-A NA   NA
     130  NaSSa Placebo NA   NA
     130    TCA   NaSSa NA   NA
     130    TCA Placebo NA   NA
     131   SSRI    SNRI NA   NA

Warning: Note, treatments within a comparison have been re-sorted in increasing order.
> #
> # (2) Early remission
> #
> p2 <- pairwise(treat = list(treatment1, treatment2, treatment3),
+                event = list(remi1, remi2, remi3),
+                n = list(n1, n2, n3),
+                studlab = id, data = Linde2015, sm = "OR")
Warning: Comparisons with missing TE / seTE or zero seTE will not be considered in network meta-analysis.
Comparisons will not be considered in network meta-analysis:
 TE seTE studlab        treat1  treat2 event1  n1 event2  n2 incr allstudies
 NA   NA       1           TCA    SNRI     NA  75     NA  78  0.0      FALSE
 NA   NA      11           TCA    SSRI     NA 108     NA  99  0.0      FALSE
 NA   NA      14           TCA    SSRI     NA  10     NA  11  0.0      FALSE
 NA   NA      18           TCA Placebo     NA  73     NA  73  0.0      FALSE
 NA   NA      20           TCA    SSRI     NA  55     NA  51  0.0      FALSE
 NA   NA      26          SSRI Placebo     NA 314     NA 154  0.0      FALSE
 NA   NA      53          SSRI   NaSSa     NA 122     NA 121  0.0      FALSE
 NA   NA      56           TCA    SSRI     NA  92     NA 380  0.0      FALSE
 NA   NA      73     Hypericum Placebo     NA  55     NA  57  0.0      FALSE
 NA   NA      90           TCA    SSRI     NA  42     NA  42  0.0      FALSE
 NA   NA      96           TCA    SSRI      0  30      0  29  0.5      FALSE
 NA   NA     121 Low-dose SARI   NaSSa     NA  43     NA  40  0.0      FALSE
 NA   NA     130           TCA   NaSSa     NA  35     NA  36  0.0      FALSE
 NA   NA       1           TCA Placebo     NA  75     NA  76  0.0      FALSE
 NA   NA      11           TCA Placebo     NA 108     NA 101  0.0      FALSE
 NA   NA      53          SSRI Placebo     NA 122     NA 129  0.0      FALSE
 NA   NA     130           TCA Placebo     NA  35     NA  34  0.0      FALSE
 NA   NA       1          SNRI Placebo     NA  78     NA  76  0.0      FALSE
 NA   NA      11          SSRI Placebo     NA  99     NA 101  0.0      FALSE
 NA   NA      53         NaSSa Placebo     NA 121     NA 129  0.0      FALSE
 NA   NA     130         NaSSa Placebo     NA  36     NA  34  0.0      FALSE
  id           author year    treatment1 treatment2 treatment3 n1.orig resp1
   1        Lecrubier 1997           TCA       SNRI    Placebo      75    49
  11           Doogan 1994           TCA       SSRI    Placebo     108    48
  14 Barge-Schaapveld 1995           TCA       SSRI                 10    NA
  18     Boyer Teil 2 1996           TCA    Placebo                 73    NA
  20             Moon 1994           TCA       SSRI                 55    29
  26           Lepola 2003          SSRI    Placebo                314   183
  53             Malt 1999          SSRI      NaSSa    Placebo     122    66
  56        Rosenberg 1994           TCA       SSRI                 92    49
  73            König 1993     Hypericum    Placebo                 55    32
  90     Fairwheather 1999           TCA       SSRI                 42    21
  96      GSK-PARMDUK 1986           TCA       SSRI                 30    11
 121         Richards 1982 Low-dose SARI      NaSSa                 43    27
 130           Murphy 1976           TCA      NaSSa    Placebo      35    NA
   1        Lecrubier 1997           TCA       SNRI    Placebo      75    49
  11           Doogan 1994           TCA       SSRI    Placebo     108    48
  53             Malt 1999          SSRI      NaSSa    Placebo     122    66
 130           Murphy 1976           TCA      NaSSa    Placebo      35    NA
   1        Lecrubier 1997           TCA       SNRI    Placebo      75    49
  11           Doogan 1994           TCA       SSRI    Placebo     108    48
  53             Malt 1999          SSRI      NaSSa    Placebo     122    66
 130           Murphy 1976           TCA      NaSSa    Placebo      35    NA
 remi1 loss1 loss.ae1 ae1 n2.orig resp2 remi2 loss2 loss.ae2 ae2  n3 resp3
    NA    23       10  NA      78    60    NA    23       11  NA  76    48
    NA    12        2  32      99    50    NA    16        5  33 101    40
    NA    NA        0   5      11    NA    NA    NA        0   3  NA    NA
    NA    33       17  63      73    NA    NA    35        2  43  NA    NA
    NA    10       10  37      51    27    NA     4        2  26  NA    NA
    NA    17       10 212     154    74    NA    15        4  92  NA    NA
    NA    NA       12  NA     121    60    NA    NA       18  NA 129    59
    NA    18       12  NA     380   202    NA    54       32  NA  NA    NA
    NA     6        2  12      57    29    NA     7        5  22  NA    NA
    NA    NA       NA  NA      42    15    NA    NA       NA  NA  NA    NA
     0    10       10  26      29    15     0    10        9  23  NA    NA
    NA     8        2  20      40    15    NA    15       10  28  NA    NA
    NA     8       NA  NA      36    NA    NA     5       NA  NA  34    NA
    NA    23       10  NA      78    60    NA    23       11  NA  76    48
    NA    12        2  32      99    50    NA    16        5  33 101    40
    NA    NA       12  NA     121    60    NA    NA       18  NA 129    59
    NA     8       NA  NA      36    NA    NA     5       NA  NA  34    NA
    NA    23       10  NA      78    60    NA    23       11  NA  76    48
    NA    12        2  32      99    50    NA    16        5  33 101    40
    NA    NA       12  NA     121    60    NA    NA       18  NA 129    59
    NA     8       NA  NA      36    NA    NA     5       NA  NA  34    NA
 remi3 loss3 loss.ae3 ae3
    NA    19        4  NA
    NA    11        3  28
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA        6  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA    NA       NA  NA
    NA     6       NA  NA
    NA    19        4  NA
    NA    11        3  28
    NA    NA        6  NA
    NA     6       NA  NA
    NA    19        4  NA
    NA    11        3  28
    NA    NA        6  NA
    NA     6       NA  NA
> #
> net2 <- netmeta(p2,
+                 comb.fixed = FALSE, comb.random = TRUE,
+                 seq = trts, ref = "Placebo")
Warning: Comparisons with missing TE / seTE or zero seTE not considered in network meta-analysis.
Comparisons not considered in network meta-analysis:
 studlab        treat1  treat2 TE seTE
       1           TCA Placebo NA   NA
       1           TCA    SNRI NA   NA
       1          SNRI Placebo NA   NA
      11          SSRI Placebo NA   NA
      11           TCA Placebo NA   NA
      11           TCA    SSRI NA   NA
      14           TCA    SSRI NA   NA
      18           TCA Placebo NA   NA
      20           TCA    SSRI NA   NA
      26          SSRI Placebo NA   NA
      53         NaSSa Placebo NA   NA
      53          SSRI   NaSSa NA   NA
      53          SSRI Placebo NA   NA
      56           TCA    SSRI NA   NA
      73     Hypericum Placebo NA   NA
      90           TCA    SSRI NA   NA
      96           TCA    SSRI NA   NA
     121 Low-dose SARI   NaSSa NA   NA
     130         NaSSa Placebo NA   NA
     130           TCA   NaSSa NA   NA
     130           TCA Placebo NA   NA

Warning: Note, treatments within a comparison have been re-sorted in increasing order.
> #
> # Partial order of treatment rankings
> #
> po <- netposet(netrank(net1, small.values = "bad"),
+                netrank(net2, small.values = "bad"),
+                outcomes = outcomes)
> #
> # Hasse diagram
> #
> hasse(po)
Error: Library 'hasseDiagram' missing.
  Please use the following R commands for installation:
  source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
  biocLite("Rgraphviz")
  install.packages("hasseDiagram")
Execution halted