• using R version 4.6.0 (2026-04-24 ucrt)
• using platform: x86_64-w64-mingw32
• R was compiled by     gcc.exe (GCC) 14.3.0     GNU Fortran (GCC) 14.3.0
• running under: Windows Server 2022 x64 (build 20348)
• using session charset: UTF-8 * current time: 2026-05-06 09:34:45 UTC
• checking for file 'spinebil/DESCRIPTION' ... OK
• checking extension type ... Package
• this is package 'spinebil' version '1.0.5'
• package encoding: UTF-8
• checking package namespace information ... OK
• checking package dependencies ... OK
• checking if this is a source package ... OK
• checking if there is a namespace ... OK
• checking for hidden files and directories ... OK
• checking for portable file names ... OK
• checking whether package 'spinebil' can be installed ... OK See the install log for details.
• checking installed package size ... OK
• checking package directory ... OK
• checking 'build' directory ... OK
• checking DESCRIPTION meta-information ... OK
• checking top-level files ... OK
• checking for left-over files ... OK
• checking index information ... OK
• checking package subdirectories ... OK
• checking code files for non-ASCII characters ... OK
• checking R files for syntax errors ... OK
• checking whether the package can be loaded ... [1s] OK
• checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... [0s] OK
• checking whether the package can be unloaded cleanly ... [1s] OK
• checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... [0s] OK
• checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... [1s] OK
• checking loading without being on the library search path ... [1s] OK
• checking use of S3 registration ... OK
• checking dependencies in R code ... OK
• checking S3 generic/method consistency ... OK
• checking replacement functions ... OK
• checking foreign function calls ... OK
• checking R code for possible problems ... [3s] OK
• checking Rd files ... [1s] OK
• checking Rd metadata ... OK
• checking Rd cross-references ... OK
• checking for missing documentation entries ... OK
• checking for code/documentation mismatches ... OK
• checking Rd \usage sections ... OK
• checking Rd contents ... OK
• checking for unstated dependencies in examples ... OK
• checking installed files from 'inst/doc' ... OK
• checking files in 'vignettes' ... OK
• checking examples ... [35s] OK
• checking for unstated dependencies in vignettes ... OK
• checking package vignettes ... OK
• checking re-building of vignette outputs ... [207s] ERROR Error(s) in re-building vignettes: --- re-building 'more_descriptives.qmd' using html processing file: more_descriptives.qmd  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ─ 100%  Progress: ── 100%  Progress: ─── 100%  Progress: ──── 100%  Progress: ──── 100%  Progress: ───── 100%  Progress: ───── 100%  Progress: ────── 100%  Progress: ────── 100%  Progress: ─────── 100%  Progress: ──────── 100%  Progress: ──────── 100%  Progress: ───────── 100%  Progress: ───────── 100%  Progress: ────────── 100%  Progress: ─────────── 100%  Progress: ──────────── 100%  Progress: ──────────── 100%  Progress: ───────────── 100%  Progress: ───────────── 100%  Progress: ────────────── 100%  Progress: ────────────── 100%  Progress: ─────────────── 100%  Progress: ──────────────── 100%  Progress: ──────────────── 100%  Progress: ──────────────── 100%  Progress: ───────────────── 100%  Progress: ────────────────── 100%  Progress: ────────────────── 100%  Progress: ─────────────────── 100%  Progress: ─────────────────── 100%  Progress: ─────────────────── 100%  Progress: ──────────────────── 100%  Progress: ───────────────────── 100%  Progress: ───────────────────── 100%  Progress: ────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%  Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%output file: more_descriptives.knit.md pandoc   to: html   output-file: more_descriptives.html   standalone: true   embed-resources: true   wrap: none   default-image-extension: png   css:     - >-       D:/RCompile/CRANpkg/lib/4.6/quarto/rmarkdown/template/quarto_vignette/resources/vignette.css   variables: {}    metadata   document-css: false   lang: en   engines:     - path: C:\Program Files\Quarto\share\extension-subtrees\julia-engine\_extensions\julia-engine\julia-engine.js   minimal: true   theme: none   title: Exploring Potential of Functions to be used for Projection Pursuit   vignette: |     %\VignetteIndexEntry{More Descriptive Analysis of Projection Pursuit Indices} %\VignetteEngine{quarto::html} %\VignetteEncoding{UTF-8}    Output created: more_descriptives.html --- finished re-building 'more_descriptives.qmd' --- re-building 'ppi_diagnostics.qmd' using html processing file: ppi_diagnostics.qmd Error in `dplyr::summarise()`: ℹ In argument: `intermediate_scags(...)`. ℹ In group 1: `Var1 = V2`, `Var2 = V1`. Caused by error in `colnames<-`: ! attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions Backtrace:      ▆   1. ├─spinebil::profile_rotation(d, index_list, index_labels, n = 50)   2. │ └─spinebil (local) idx(dprj)   3. │ └─cassowaryr::calc_scags_wide(as.data.frame(mat), index_name)   4. │ └─... %>% dplyr::ungroup()   5. ├─dplyr::ungroup(.)   6. ├─dplyr::summarise(...)   7. ├─dplyr:::summarise.grouped_df(...)   8. │ └─dplyr:::summarise_cols(.data, dplyr_quosures(...), by, "summarise")   9. │ ├─base::withCallingHandlers(...)  10. │ └─dplyr:::map(quosures, summarise_eval_one, mask = mask)  11. │ └─base::lapply(.x, .f, ...)  12. │ └─dplyr (local) FUN(X[[i]], ...)  13. │ └─mask$eval_all_summarise(quo)  14. │ └─dplyr (local) eval()  15. ├─cassowaryr:::intermediate_scags(...)  16. │ └─cassowaryr::calc_scags(x, y, scags, out.rm, euclid)  17. │ └─cassowaryr:::original_and_robust(x, y)  18. │ └─cassowaryr::scree(x, y)  19. │ └─alphahull::delvor(xy)  20. │ └─interp::tri.mesh(X)  21. │ └─base::`colnames<-`(...)  22. │ └─base::stop("attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions")  23. └─base::.handleSimpleError(...)  24. └─dplyr (local) h(simpleError(msg, call))  25. └─dplyr (local) handler(cnd)  26. └─rlang::abort(message, class = error_class, parent = parent, call = error_call) Quitting from ppi_diagnostics.qmd:279-287 [unnamed-chunk-7] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ <error/rlang_error> Error in `dplyr::summarise()`: ℹ In argument: `intermediate_scags(...)`. ℹ In group 1: `Var1 = V2`, `Var2 = V1`. Caused by error in `colnames<-`: ! attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions --- Backtrace:      ▆   1. ├─spinebil::profile_rotation(d, index_list, index_labels, n = 50)   2. │ └─spinebil (local) idx(dprj)   3. │ └─cassowaryr::calc_scags_wide(as.data.frame(mat), index_name)   4. │ └─... %>% dplyr::ungroup()   5. ├─dplyr::ungroup(.)   6. ├─dplyr::summarise(...)   7. ├─dplyr:::summarise.grouped_df(...)   8. │ └─dplyr:::summarise_cols(.data, dplyr_quosures(...), by, "summarise")   9. │ ├─base::withCallingHandlers(...)  10. │ └─dplyr:::map(quosures, summarise_eval_one, mask = mask)  11. │ └─base::lapply(.x, .f, ...)  12. │ └─dplyr (local) FUN(X[[i]], ...)  13. │ └─mask$eval_all_summarise(quo)  14. │ └─dplyr (local) eval()  15. └─cassowaryr:::intermediate_scags(...)  16. └─cassowaryr::calc_scags(x, y, scags, out.rm, euclid)  17. └─cassowaryr:::original_and_robust(x, y)  18. └─cassowaryr::scree(x, y)  19. └─alphahull::delvor(xy)  20. └─interp::tri.mesh(X)  21. └─base::`colnames<-`(...)  22. └─base::stop("attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions") ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Execution halted WARN: Error encountered when rendering files Error: processing vignette 'ppi_diagnostics.qmd' failed with diagnostics: ! Error running quarto CLI from R. Caused by error in `quarto_render()`: ✖ Error returned by quarto CLI.   -----------------------------         processing file: ppi_diagnostics.qmd   Error in `dplyr::summarise()`:   ℹ In argument: `intermediate_scags(...)`.   ℹ In group 1: `Var1 = V2`, `Var2 = V1`.   Caused by error in `colnames<-`:   ! attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions   Backtrace:   ▆   1. ├─spinebil::profile_rotation(d, index_list, index_labels, n = 50)   2. │ └─spinebil (local) idx(dprj)   3. │ └─cassowaryr::calc_scags_wide(as.data.frame(mat), index_name)   4. │ └─... %>% dplyr::ungroup()   5. ├─dplyr::ungroup(.)   6. ├─dplyr::summarise(...)   7. ├─dplyr:::summarise.grouped_df(...)   8. │ └─dplyr:::summarise_cols(.data, dplyr_quosures(...), by, "summarise")   9. │ ├─base::withCallingHandlers(...)   10. │ └─dplyr:::map(quosures, summarise_eval_one, mask = mask)   11. │ └─base::lapply(.x, .f, ...)   12. │ └─dplyr (local) FUN(X[[i]], ...)   13. │ └─mask$eval_all_summarise(quo)   14. │ └─dplyr (local) eval()   15. ├─cassowaryr:::intermediate_scags(...)   16. │ └─cassowaryr::calc_scags(x, y, scags, out.rm, euclid)   17. │ └─cassowaryr:::original_and_robust(x, y)   18. │ └─cassowaryr::scree(x, y)   19. │ └─alphahull::delvor(xy)   20. │ └─interp::tri.mesh(X)   21. │ └─base::`colnames<-`(...)   22. │ └─base::stop("attempt to set 'colnames' on an object with less than two   dimensions")   23. └─base::.handleSimpleError(...)   24. └─dplyr (local) h(simpleError(msg, call))   25. └─dplyr (local) handler(cnd)   26. └─rlang::abort(message, class = error_class, parent = parent, call =   error_call)      Quitting from ppi_diagnostics.qmd:279-287 [unnamed-chunk-7]   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~   <error/rlang_error>   Error in `dplyr::summarise()`:   ℹ In argument: `intermediate_scags(...)`.   ℹ In group 1: `Var1 = V2`, `Var2 = V1`.   Caused by error in `colnames<-`:   ! attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions   ---   Backtrace:   ▆   1. ├─spinebil::profile_rotation(d, index_list, index_labels, n = 50)   2. │ └─spinebil (local) idx(dprj)   3. │ └─cassowaryr::calc_scags_wide(as.data.frame(mat), index_name)   4. │ └─... %>% dplyr::ungroup()   5. ├─dplyr::ungroup(.)   6. ├─dplyr::summarise(...)   7. ├─dplyr:::summarise.grouped_df(...)   8. │ └─dplyr:::summarise_cols(.data, dplyr_quosures(...), by, "summarise")   9. │ ├─base::withCallingHandlers(...)   10. │ └─dplyr:::map(quosures, summarise_eval_one, mask = mask)   11. │ └─base::lapply(.x, .f, ...)   12. │ └─dplyr (local) FUN(X[[i]], ...)   13. │ └─mask$eval_all_summarise(quo)   14. │ └─dplyr (local) eval()   15. └─cassowaryr:::intermediate_scags(...)   16. └─cassowaryr::calc_scags(x, y, scags, out.rm, euclid)   17. └─cassowaryr:::original_and_robust(x, y)   18. └─cassowaryr::scree(x, y)   19. └─alphahull::delvor(xy)   20. └─interp::tri.mesh(X)   21. └─base::`colnames<-`(...)   22. └─base::stop("attempt to set 'colnames' on an object with less than two   dimensions")   ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~      Execution halted   WARN: Error encountered when rendering files    Caused by error in `processx::run()`: ! System command 'quarto.exe' failed --- failed re-building 'ppi_diagnostics.qmd' --- re-building 'spinebil.qmd' using html processing file: spinebil.qmd output file: spinebil.knit.md pandoc   to: html   output-file: spinebil.html   standalone: true   embed-resources: true   wrap: none   default-image-extension: png   css:     - >-       D:/RCompile/CRANpkg/lib/4.6/quarto/rmarkdown/template/quarto_vignette/resources/vignette.css   variables: {}    metadata   document-css: false   lang: en   engines:     - path: C:\Program Files\Quarto\share\extension-subtrees\julia-engine\_extensions\julia-engine\julia-engine.js   minimal: true   theme: none   title: An introduction to the spinebil package   vignette: |     %\VignetteIndexEntry{An introduction to the spinebil package} %\VignetteEngine{quarto::html} %\VignetteEncoding{UTF-8}    Output created: spinebil.html --- finished re-building 'spinebil.qmd' SUMMARY: processing the following file failed:   'ppi_diagnostics.qmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted
• checking PDF version of manual ... [19s] OK
• checking HTML version of manual ... [6s] OK
• DONE

Status: 1 ERROR