• using R version 2.14.0 (2011-10-31)
  • using platform: i386-apple-darwin9.8.0 (32-bit)
  • using session charset: ASCII
  • checking for file 'tsDyn/DESCRIPTION' ... OK
  • checking extension type ... Package
  • this is package 'tsDyn' version '0.7-62'
  • checking package namespace information ... OK
  • checking package dependencies ... OK
  • checking if this is a source package ... OK
  • checking if there is a namespace ... OK
  • checking for executable files ... OK
  • checking whether package 'tsDyn' can be installed ... OK
  • checking installed package size ... OK
  • checking package directory ... OK
  • checking for portable file names ... OK
  • checking for sufficient/correct file permissions ... OK
  • checking DESCRIPTION meta-information ... OK
  • checking top-level files ... OK
  • checking index information ... OK
  • checking package subdirectories ... OK
  • checking R files for non-ASCII characters ... OK
  • checking R files for syntax errors ... OK
  • loading checks for arch 'i386'
    ** checking whether the package can be loaded ... OK
    ** checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
    ** checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
    ** checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK
    ** checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
  • loading checks for arch 'x86_64'
    ** checking whether the package can be loaded ... OK
    ** checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
    ** checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
    ** checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK
    ** checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
  • checking for unstated dependencies in R code ... OK
  • checking S3 generic/method consistency ... OK
  • checking replacement functions ... OK
  • checking foreign function calls ... OK
  • checking R code for possible problems ... OK
  • checking Rd files ... OK
  • checking Rd metadata ... OK
  • checking Rd cross-references ... OK
  • checking for missing documentation entries ... OK
  • checking for code/documentation mismatches ... OK
  • checking Rd \usage sections ... OK
  • checking Rd contents ... OK
  • checking for unstated dependencies in examples ... OK
  • checking contents of 'data' directory ... OK
  • checking data for non-ASCII characters ... OK
  • checking data for ASCII and uncompressed saves ... OK
  • checking line endings in C/C++/Fortran sources/headers ... OK
  • checking line endings in Makefiles ... OK
  • checking for portable use of $(BLAS_LIBS) and $(LAPACK_LIBS) ... OK
  • checking compiled code ... OK
  • checking sizes of PDF files under 'inst/doc' ... OK
  • checking examples ...
    ** running examples for arch 'i386' ... OK
    ** running examples for arch 'x86_64' ... OK
  • checking for unstated dependencies in tests ... OK
  • checking tests ...
    ** running tests for arch 'i386' OK
    Running '00SetarAndFriends.R'
    Comparing '00SetarAndFriends.Rout' to '00SetarAndFriends.Rout.save' ...1a2,19
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    4c22
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    571,576c589,594
    < 95 -0.13264030 0.09671450
    < 96 0.12582712 -0.28920157
    < 97 0.17823756 0.04344887
    < 98 -0.15492010 -0.08167471
    < 99 0.09760711 0.15553665
    < 100 0.31886073 0.01232640
    ---
    > 95 -0.1326403 0.09671450
    > 96 0.1258271 -0.28920157
    > 97 0.1782376 0.04344887
    > 98 -0.1549201 -0.08167471
    > 99 0.0976071 0.15553665
    > 100 0.3188607 0.01232640
    723,724c741
    < Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%
    < >
    ---
    > Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%>
    759,760c776
    < Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%
    < >
    ---
    > Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%>
    794,795c810
    < Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%
    < >
    ---
    > Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%>
    Running 'TVECM_HSTEST.R'
    Comparing 'TVECM_HSTEST.Rout' to 'TVECM_HSTEST.Rout.save' ...1a2,19
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    4c22
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    34c52
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    63c81
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    89c107
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    94c112
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    99c117
    < 15.1108 15.1244 15.13527
    ---
    > 15.1108 15.12440 15.13527
    113c131
    < 15.1108 15.1244 15.13527
    ---
    > 15.1108 15.12440 15.13527
    Running 'VECM.R'
    Comparing 'VECM.Rout' to 'VECM.Rout.save' ...1a2,21
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    >
    > [Previously saved workspace restored]
    4c24
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    180,186d199
    <
    < Attaching package: 'zoo'
    <
    < The following object(s) are masked from 'package:base':
    <
    < as.Date, as.Date.numeric
    <
    201c214
    < [1] -73607.49
    ---
    > [1] -73607.5
    Running 'lstar.R'
    Comparing 'lstar.Rout' to 'lstar.Rout.save' ...1a2,20
    > R version 2.13.0 (2011-04-13)
    > Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    > Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    4c23
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.7-6. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    11a31,37
    >
    > Attaching package: 'snow'
    >
    > The following object(s) are masked from 'package:base':
    >
    > enquote
    >
    70c96
    < phi1.0 0.487065 0.204273 2.3844 0.0171081 *
    ---
    > phi1.0 0.487065 0.204274 2.3844 0.0171081 *
    73,76c99,102
    < phi2.0 -1.051380 2.448918 -0.4293 0.6676873
    < phi2.1 0.424320 0.173427 2.4467 0.0144176 *
    < phi2.2 -0.248832 0.589105 -0.4224 0.6727408
    < gamma 11.000030 9.664956 1.1381 0.2550639
    ---
    > phi2.0 -1.051380 2.448918 -0.4293 0.6676874
    > phi2.1 0.424320 0.173427 2.4467 0.0144177 *
    > phi2.2 -0.248832 0.589105 -0.4224 0.6727409
    > gamma 11.000030 9.664958 1.1381 0.2550640
    154,155c180,181
    < gamma 47.950869 61.803289 0.7759 0.43783
    < th 2.880884 0.057213 50.3533 < 2.2e-16 ***
    ---
    > gamma 47.950869 61.803765 0.7759 0.43783
    > th 2.880884 0.057214 50.3531 < 2.2e-16 ***
    Running 'regime.R'
    Running 'toMlm.R'
    Comparing 'toMlm.Rout' to 'toMlm.Rout.save' ...1a2,21
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    >
    > [Previously saved workspace restored]
    4c24
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ** running tests for arch 'x86_64' OK
    Running '00SetarAndFriends.R'
    Comparing '00SetarAndFriends.Rout' to '00SetarAndFriends.Rout.save' ...1a2,19
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    4c22
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    571,576c589,594
    < 95 -0.13264030 0.09671450
    < 96 0.12582712 -0.28920157
    < 97 0.17823756 0.04344887
    < 98 -0.15492010 -0.08167471
    < 99 0.09760711 0.15553665
    < 100 0.31886073 0.01232640
    ---
    > 95 -0.1326403 0.09671450
    > 96 0.1258271 -0.28920157
    > 97 0.1782376 0.04344887
    > 98 -0.1549201 -0.08167471
    > 99 0.0976071 0.15553665
    > 100 0.3188607 0.01232640
    723,724c741
    < Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%
    < >
    ---
    > Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%>
    759,760c776
    < Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%
    < >
    ---
    > Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%>
    794,795c810
    < Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%
    < >
    ---
    > Percentage of Observations in each regime: 71.4% 10.2% 18.4%>
    Running 'TVECM_HSTEST.R'
    Comparing 'TVECM_HSTEST.Rout' to 'TVECM_HSTEST.Rout.save' ...1a2,19
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    4c22
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    34c52
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    63c81
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    89c107
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    94c112
    < Test Statistic: 18.2336 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    ---
    > Test Statistic: 18.23360 (Maximized for threshold value: -0.1002829 )
    99c117
    < 15.1108 15.1244 15.13527
    ---
    > 15.1108 15.12440 15.13527
    113c131
    < 15.1108 15.1244 15.13527
    ---
    > 15.1108 15.12440 15.13527
    Running 'VECM.R'
    Comparing 'VECM.Rout' to 'VECM.Rout.save' ...1a2,21
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    >
    > [Previously saved workspace restored]
    4c24
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    180,186d199
    <
    < Attaching package: 'zoo'
    <
    < The following object(s) are masked from 'package:base':
    <
    < as.Date, as.Date.numeric
    <
    201c214
    < [1] -73607.49
    ---
    > [1] -73607.5
    Running 'lstar.R'
    Comparing 'lstar.Rout' to 'lstar.Rout.save' ...1a2,20
    > R version 2.13.0 (2011-04-13)
    > Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    > Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    4c23
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.7-6. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    11a31,37
    >
    > Attaching package: 'snow'
    >
    > The following object(s) are masked from 'package:base':
    >
    > enquote
    >
    70c96
    < phi1.0 0.487065 0.204273 2.3844 0.0171081 *
    ---
    > phi1.0 0.487065 0.204274 2.3844 0.0171081 *
    73,76c99,102
    < phi2.0 -1.051380 2.448918 -0.4293 0.6676873
    < phi2.1 0.424320 0.173427 2.4467 0.0144176 *
    < phi2.2 -0.248832 0.589105 -0.4224 0.6727408
    < gamma 11.000030 9.664956 1.1381 0.2550639
    ---
    > phi2.0 -1.051380 2.448918 -0.4293 0.6676874
    > phi2.1 0.424320 0.173427 2.4467 0.0144177 *
    > phi2.2 -0.248832 0.589105 -0.4224 0.6727409
    > gamma 11.000030 9.664958 1.1381 0.2550640
    154,155c180,181
    < gamma 47.950869 61.803289 0.7759 0.43783
    < th 2.880884 0.057213 50.3533 < 2.2e-16 ***
    ---
    > gamma 47.950869 61.803765 0.7759 0.43783
    > th 2.880884 0.057214 50.3531 < 2.2e-16 ***
    Running 'regime.R'
    Running 'toMlm.R'
    Comparing 'toMlm.Rout' to 'toMlm.Rout.save' ...1a2,21
    > R version 2.11.1 (2010-05-31)
    > Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
    > ISBN 3-900051-07-0
    >
    > R est un logiciel libre livré sans AUCUNE GARANTIE.
    > Vous pouvez le redistribuer sous certaines conditions.
    > Tapez 'license()' ou 'licence()' pour plus de détails.
    >
    > R est un projet collaboratif avec de nombreux contributeurs.
    > Tapez 'contributors()' pour plus d'information et
    > 'citation()' pour la façon de le citer dans les publications.
    >
    > Tapez 'demo()' pour des démonstrations, 'help()' pour l'aide
    > en ligne ou 'help.start()' pour obtenir l'aide au format HTML.
    > Tapez 'q()' pour quitter R.
    >
    > REvolution R enhancements not installed. For improved
    > performance and other extensions: apt-get install revolution-r
    >
    > [Previously saved workspace restored]
    4c24
    < This is mgcv 1.7-12. For overview type 'help("mgcv-package")'.
    ---
    > This is mgcv 1.6-2. For overview type 'help("mgcv-package")'.
  • checking for unstated dependencies in vignettes ... OK
  • checking package vignettes in 'inst/doc' ... OK
  • checking running R code from vignettes ... OK
  • checking re-building of vignette PDFs ... OK
  • checking PDF version of manual ... OK
  • elapsed time (check, wall clock): 5:35