• using R version 3.0.1 Patched (2013-05-24 r62797)
  • using platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
  • using session charset: UTF-8
  • checking for file ‘lasso2/DESCRIPTION’ ... OK
  • this is package ‘lasso2’ version ‘1.2-16’
  • checking package namespace information ... OK
  • checking package dependencies ... OK
  • checking if this is a source package ... OK
  • checking if there is a namespace ... OK
  • checking for executable files ... OK
  • checking for hidden files and directories ... OK
  • checking for portable file names ... OK
  • checking for sufficient/correct file permissions ... OK
  • checking whether package ‘lasso2’ can be installed ... OK
  • checking installed package size ... OK
  • checking package directory ... OK
  • checking DESCRIPTION meta-information ... OK
  • checking top-level files ... OK
  • checking for left-over files ... OK
  • checking index information ... OK
  • checking package subdirectories ... OK
  • checking R files for non-ASCII characters ... OK
  • checking R files for syntax errors ... OK
  • checking whether the package can be loaded ... OK
  • checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
  • checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
  • checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK
  • checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
  • checking loading without being on the library search path ... OK
  • checking for unstated dependencies in R code ... OK
  • checking S3 generic/method consistency ... OK
  • checking replacement functions ... OK
  • checking foreign function calls ... OK
  • checking R code for possible problems ... OK
  • checking Rd files ... OK
  • checking Rd metadata ... OK
  • checking Rd cross-references ... OK
  • checking for missing documentation entries ... OK
  • checking for code/documentation mismatches ... OK
  • checking Rd \usage sections ... OK
  • checking Rd contents ... OK
  • checking for unstated dependencies in examples ... OK
  • checking contents of ‘data’ directory ... OK
  • checking data for non-ASCII characters ... OK
  • checking data for ASCII and uncompressed saves ... OK
  • checking line endings in C/C++/Fortran sources/headers ... OK
  • checking line endings in Makefiles ... OK
  • checking for portable use of $(BLAS_LIBS) and $(LAPACK_LIBS) ... OK
  • checking compiled code ... OK
  • checking sizes of PDF files under ‘inst/doc’ ... OK
  • checking installed files from ‘inst/doc’ ... OK
  • checking examples ... [1s/1s] OK
  • checking for unstated dependencies in tests ... OK
  • checking tests ... [1s/1s] OK
    Running ‘l1ce-tst.R’ [1s/1s]
    Comparing ‘l1ce-tst.Rout’ to ‘l1ce-tst.Rout.save’ ...96c96
    < [17,] 1.00000000 2.243950e+01 3.363976e-14
    ---
    > [17,] 1.00000000 2.243950e+01 3.153033e-14
    160c160
    < [17,] 1.000000 1.843985e+00 1.110223e-14
    ---
    > [17,] 1.000000 1.843985e+00 6.161738e-15
    231,248c231,248
    < (Intercept) x1 x3 x6 x7 x10
    < 4.993268773 3.886469718 10.583817348 0.103696072 0.181117469 0.079552267
    < x11 x13 x14 x17 x18 x19
    < 0.331065992 0.498030247 0.021330767 0.137737874 0.274894317 0.091630588
    < x22 x25 x27 x29 x33 x34
    < 0.311378230 0.338323601 0.698037117 0.385483927 0.224329070 0.078139196
    < x35 x36 x37 x45 x48 x54
    < 0.232380284 0.327718265 0.059664889 0.133877286 0.167223204 0.267735545
    < x56 x57 x58 x59 x62 x63
    < 0.312109537 0.013370679 0.171681971 0.478626374 0.035873536 0.079115348
    < x65 x66 x68 x70 x71 x77
    < 0.040516052 0.201973956 0.121222783 0.041063415 0.255191669 0.216901803
    < x88 x92 x96 x99 x100 x106
    < 0.147477734 0.103180905 0.018468176 0.336339183 0.014551820 0.299115603
    < x107 x108 x109 x111 x112 x114
    < 0.288947022 0.333913483 0.142641866 0.177917076 0.106611744 0.309545149
    < x116 x118 x119
    < 0.004955428 0.340089259 0.243038111
    ---
    > (Intercept) x1 x3 x6 x10 x11
    > 4.91296729 3.31760895 11.63573297 0.47717061 0.56478623 1.13528934
    > x12 x13 x14 x18 x22 x23
    > 0.28021053 0.86783409 1.09057611 0.40424676 1.63665339 0.06265258
    > x25 x26 x27 x28 x29 x34
    > 0.09763864 0.42791015 1.62728477 0.56937674 0.82846065 0.60398128
    > x35 x36 x37 x42 x44 x45
    > 0.20297610 0.96774590 0.70393373 0.30441578 0.18007896 0.48350210
    > x48 x54 x58 x60 x61 x63
    > 0.67437553 1.00765201 0.89794252 0.24255411 0.42302976 0.08508224
    > x64 x70 x72 x73 x77 x86
    > 0.73056519 0.74936897 0.64350880 0.03236127 0.63724707 0.59547124
    > x88 x91 x98 x99 x100 x103
    > 0.94283080 0.18737085 0.03537850 0.56338982 0.07570137 0.20926770
    > x106 x107 x109 x111 x112 x114
    > 0.14272473 0.31799324 0.90267566 0.13526006 0.26789962 0.29351243
    > x116 x118
    > 0.07888833 0.32826177
    253,269c253,269
    < 4.993268773 3.886469718 10.583817348 0.103696072 0.181117469 0.079552267
    < x11 x13 x14 x17 x18 x19
    < 0.331065992 0.498030247 0.021330767 0.137737874 0.274894317 0.091630588
    < x22 x25 x27 x29 x33 x34
    < 0.311378230 0.338323601 0.698037117 0.385483927 0.224329070 0.078139196
    < x35 x36 x37 x45 x48 x54
    < 0.232380284 0.327718265 0.059664889 0.133877286 0.167223204 0.267735545
    < x56 x57 x58 x59 x62 x63
    < 0.312109537 0.013370679 0.171681971 0.478626374 0.035873536 0.079115348
    < x65 x66 x68 x70 x71 x77
    < 0.040516052 0.201973956 0.121222783 0.041063415 0.255191669 0.216901803
    < x88 x92 x96 x99 x100 x106
    < 0.147477734 0.103180905 0.018468176 0.336339183 0.014551820 0.299115603
    < x107 x108 x109 x111 x112 x114
    < 0.288947022 0.333913483 0.142641866 0.177917076 0.106611744 0.309545149
    < x116 x118 x119
    < 0.004955428 0.340089259 0.243038111
    ---
    > 4.949663973 3.577570581 11.155021843 0.306497828 0.019140481 0.343040912
    > x11 x12 x13 x14 x18 x22
    > 0.767770214 0.134820188 0.698838766 0.601945534 0.345134452 1.031020675
    > x25 x26 x27 x28 x29 x33
    > 0.207628392 0.173323543 1.202631234 0.282487078 0.626026313 0.095561213
    > x34 x35 x36 x37 x42 x44
    > 0.363678604 0.216413414 0.675261980 0.409511634 0.145668928 0.023168695
    > x45 x48 x54 x56 x58 x59
    > 0.323728316 0.442613819 0.669520254 0.109209500 0.566051330 0.200629918
    > x61 x63 x64 x66 x70 x72
    > 0.112168277 0.082355454 0.323102478 0.033491050 0.425682969 0.320136249
    > x77 x86 x88 x91 x99 x100
    > 0.445155002 0.239085816 0.579365268 0.023951414 0.459630768 0.047756856
    > x103 x106 x107 x108 x109 x111
    > 0.002295492 0.214193230 0.304719516 0.019390771 0.555350558 0.154753734
    > x112 x114 x116 x118 x119
    > 0.194193254 0.300839162 0.045101998 0.333666772 0.022243977
    274c274
    < [1] 2.341508e-25
    ---
    > [1] 3.851104e-25
    276c276
    < [1] 2.341508e-25
    ---
    > [1] 2.190748e-25
    299,307c299,307
    < [13,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [14,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [15,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [16,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [17,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [18,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [19,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [20,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    < [21,] NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN
    ---
    > [13,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [14,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [15,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [16,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [17,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [18,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [19,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [20,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    > [21,] 4.968 4.059 -3.053 10.065 -0.066 0.000 0.034 0.175 -0.180 0.006
    321,329c321,329
    < [13,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [14,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [15,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [16,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [17,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [18,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [19,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [20,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    < [21,] NaN NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.000
    ---
    > [13,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [14,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [15,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [16,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [17,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [18,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [19,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [20,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    > [21,] 0.000 -0.073 0.000 0.201 -0.015 -0.298 0.013 0.225 0.103 0.024 0.000
    343,351c343,351
    < [13,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [14,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [15,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [16,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [17,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [18,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [19,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [20,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [21,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    ---
    > [13,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [14,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [15,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [16,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [17,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [18,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [19,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [20,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    > [21,] -0.037 0.000 -0.247 -0.394 0.278 0.033 0.233 0.047 0.192 0.070 -0.315
    365,373c365,373
    < [13,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [14,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [15,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [16,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [17,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [18,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [19,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [20,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    < [21,] 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN
    ---
    > [13,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [14,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [15,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [16,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [17,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [18,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [19,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [20,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    > [21,] 0.000 -0.005 0.169 0.300 0.077 -0.088 0.000 0.034 0.000 -0.031 -0.152
    387,395c387,395
    < [13,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [14,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [15,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [16,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [17,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [18,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [19,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [20,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [21,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    ---
    > [13,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [14,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [15,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [16,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [17,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [18,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [19,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [20,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    > [21,] -0.165 -0.032 0.009 -0.027 0.269 0.016 -0.368 -0.031 0.033 0.075 -0.223
    409,417c409,417
    < [13,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [14,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [15,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [16,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [17,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [18,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [19,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [20,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    < [21,] NaN 0 NaN NaN NaN NaN 0.000 0.000 0.000 NaN NaN
    ---
    > [13,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [14,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [15,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [16,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [17,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [18,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [19,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [20,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    > [21,] 0.102 0 0.042 -0.246 0.225 0.386 0.000 0.000 0.000 0.154 -0.250
    431,439c431,439
    < [13,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [14,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [15,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [16,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [17,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [18,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [19,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [20,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [21,] 0.000 NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    ---
    > [13,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [14,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [15,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [16,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [17,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [18,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [19,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [20,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    > [21,] 0.000 -0.082 0 0.000 0.157 0.182 0.062 -0.202 -0.226 -0.104 -0.255
    453,461c453,461
    < [13,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [14,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [15,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [16,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [17,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [18,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [19,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [20,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    < [21,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0
    ---
    > [13,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [14,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [15,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [16,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [17,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [18,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [19,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [20,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    > [21,] 0.019 0.356 -0.084 0.210 0.113 -0.089 -0.333 -0.019 0.030 0.059 0
    475,483c475,483
    < [13,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [14,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [15,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [16,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [17,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [18,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [19,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [20,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [21,] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    ---
    > [13,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [14,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [15,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [16,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [17,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [18,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [19,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [20,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    > [21,] -0.070 0.046 -0.237 -0.510 -0.126 0.080 -0.025 -0.206 -0.365 -0.017
    497,505c497,505
    < [13,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [14,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [15,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [16,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [17,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [18,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [19,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [20,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    < [21,] NaN 0.000 NaN NaN 0 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN
    ---
    > [13,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [14,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [15,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [16,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [17,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [18,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [19,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [20,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    > [21,] -0.063 0.000 0.259 -0.014 0 0.000 -0.031 -0.074 -0.068 0.088 0.185
    519,527c519,527
    < [13,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [14,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [15,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [16,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [17,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [18,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [19,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [20,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    < [21,] NaN 0.000 NaN 0.000 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
    ---
    > [13,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [14,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [15,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [16,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [17,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [18,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [19,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [20,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    > [21,] 0.516 0.000 0.042 0.000 0.166 0.114 0.183 -0.056 -0.124 0.001 0.330
    541,549c541,549
    < [13,] NaN NaN
    < [14,] NaN NaN
    < [15,] NaN NaN
    < [16,] NaN NaN
    < [17,] NaN NaN
    < [18,] NaN NaN
    < [19,] NaN NaN
    < [20,] NaN NaN
    < [21,] NaN NaN
    ---
    > [13,] 0.097 -0.236
    > [14,] 0.097 -0.236
    > [15,] 0.097 -0.236
    > [16,] 0.097 -0.236
    > [17,] 0.097 -0.236
    > [18,] 0.097 -0.236
    > [19,] 0.097 -0.236
    > [20,] 0.097 -0.236
    > [21,] 0.097 -0.236
  • checking for unstated dependencies in vignettes ... OK
  • checking package vignettes in ‘inst/doc’ ... OK
  • checking running R code from vignettes ... [0s/0s] OK
  • checking re-building of vignette PDFs ... [0s/0s] OK
  • checking PDF version of manual ... OK