• using R version 2.13.0 Under development (unstable) (2011-03-13 r54781)
  • using platform: i386-apple-darwin9.8.0 (32-bit)
  • using session charset: ASCII
  • checking for file 'BAS/DESCRIPTION' ... OK
  • this is package 'BAS' version '0.92'
  • checking package dependencies ... OK
  • checking if this is a source package ... OK
  • checking for executable files ... OK
  • checking whether package 'BAS' can be installed ... OK
  • checking installed package size ... OK
  • checking package directory ... OK
  • checking for portable file names ... OK
  • checking for sufficient/correct file permissions ... OK
  • checking DESCRIPTION meta-information ... OK
  • checking top-level files ... OK
  • checking index information ... OK
  • checking package subdirectories ... OK
  • checking R files for non-ASCII characters ... OK
  • checking R files for syntax errors ... OK
  • loading checks for arch 'i386'
    ** checking whether the package can be loaded ... OK
    ** checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
    ** checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
  • loading checks for arch 'ppc'
    ** checking whether the package can be loaded ... OK
    ** checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
    ** checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
  • loading checks for arch 'x86_64'
    ** checking whether the package can be loaded ... OK
    ** checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
    ** checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
  • checking for unstated dependencies in R code ... OK
  • checking S3 generic/method consistency ... OK
  • checking replacement functions ... OK
  • checking foreign function calls ... OK
  • checking R code for possible problems ... OK
  • checking Rd files ... NOTE
    prepare_Rd: bayesglm.Rd:54-55: Dropping empty section \examples
  • checking Rd metadata ... OK
  • checking Rd cross-references ... OK
  • checking for missing documentation entries ... OK
  • checking for code/documentation mismatches ... OK
  • checking Rd \usage sections ... OK
  • checking Rd contents ... OK
  • checking for unstated dependencies in examples ... NOTE
    'library' or 'require' call not declared from: MASS
  • checking contents of 'data' directory ... OK
  • checking data for non-ASCII characters ... OK
  • checking data for ASCII and uncompressed saves ... OK
  • checking line endings in C/C++/Fortran sources/headers ... OK
  • checking line endings in Makefiles ... OK
  • checking for portable compilation flags in Makevars ... OK
  • checking for portable use of $(BLAS_LIBS) and $(LAPACK_LIBS) ... OK
  • checking sizes of PDF files under inst/doc ... OK
  • checking examples ...
    ** running examples for arch 'i386' ... OK
    ** running examples for arch 'ppc' ... ERROR
    Running examples in 'BAS-Ex.R' failed
    The error most likely occurred in:

    > ### Name: fitted.bma
    > ### Title: Fitted values for a BMA objects
    > ### Aliases: fitted.bma fitted
    > ### Keywords: regression
    >
    > ### ** Examples
    >
    > data(Hald)
    > hald.gprior = bas.lm(Y~ ., data=Hald, prior="ZS-null", initprobs="Uniform")
    For m=0, Initialize Tree with initial Model

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error

    powi overflow error
    > plot(Hald$Y, fitted(hald.gprior, type="HPM"))
    Error in X[, object$which[[best]] + 1, drop = FALSE] %*% object$ols[[best]] :
    requires numeric/complex matrix/vector arguments
    Calls: plot ... plot.default -> xy.coords -> fitted -> fitted.bma -> as.vector
    Execution halted
  • elapsed time (check, wall clock): 0:57