* installing *source* package ‘abess’ ...
** package ‘abess’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
checking whether the C++ compiler works... yes
checking for C++ compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables... 
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether the compiler supports GNU C++... yes
checking whether g++-13 -std=gnu++17 accepts -g... yes
checking for g++-13 -std=gnu++17 option to enable C++11 features... none needed
checking how to run the C++ preprocessor... g++-13 -std=gnu++17 -E
checking for gcc... gcc-13
checking whether the compiler supports GNU C... yes
checking whether gcc-13 accepts -g... yes
checking for gcc-13 option to enable C11 features... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc-13 -E
*****************************************************************************************
Spectra library exists. 
*****************************************************************************************
*****************************************************************************************
Complier code exists in src/ directory. Install R package according to the complier code.
*****************************************************************************************
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
using C++ compiler: ‘g++-13 (GCC) 13.2.0’
make[1]: Entering directory '/data/gannet/ripley/R/packages/tests-devel/abess/src'
g++-13 -std=gnu++17 -I"/data/gannet/ripley/R/R-devel/include" -DNDEBUG -I ../inst/include -DR_BUILD -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/Rcpp/include' -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/RcppEigen/include' -I/usr/local/include   -fopenmp  -fpic  -g -O2 -Wall -pedantic -mtune=native -Wno-ignored-attributes -Wno-parentheses -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=3 -fexceptions -fstack-protector-strong -fstack-clash-protection -fcf-protection   -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
g++-13 -std=gnu++17 -I"/data/gannet/ripley/R/R-devel/include" -DNDEBUG -I ../inst/include -DR_BUILD -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/Rcpp/include' -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/RcppEigen/include' -I/usr/local/include   -fopenmp  -fpic  -g -O2 -Wall -pedantic -mtune=native -Wno-ignored-attributes -Wno-parentheses -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=3 -fexceptions -fstack-protector-strong -fstack-clash-protection -fcf-protection   -c api.cpp -o api.o
In file included from api.cpp:21:
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'class abessOrdinal<Eigen::Matrix<double, -1, -1> >':
api.cpp:116:90:   required from here
AlgorithmGLM.h:57:29: warning: 'Eigen::MatrixXd _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::gradient(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::MatrixXd = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]' was hidden [-Woverloaded-virtual=]
   57 |     virtual Eigen::MatrixXd gradient(T4 &X_full, T1 &y, Eigen::VectorXd &weights, T2 &beta_full) {
      |                             ^~~~~~~~
AlgorithmGLM.h:1607:10: note:   by 'bool abessOrdinal<T4>::gradient(T4&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&) [with T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::MatrixXd = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]'
 1607 |     bool gradient(T4 &X, Eigen::MatrixXd &y, Eigen::VectorXd &weights, Eigen::MatrixXd &beta, Eigen::VectorXd &coef0,
      |          ^~~~~~~~
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'class abessOrdinal<Eigen::SparseMatrix<double, 0, int> >':
api.cpp:173:90:   required from here
AlgorithmGLM.h:57:29: warning: 'Eigen::MatrixXd _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::gradient(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::MatrixXd = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]' was hidden [-Woverloaded-virtual=]
   57 |     virtual Eigen::MatrixXd gradient(T4 &X_full, T1 &y, Eigen::VectorXd &weights, T2 &beta_full) {
      |                             ^~~~~~~~
AlgorithmGLM.h:1607:10: note:   by 'bool abessOrdinal<T4>::gradient(T4&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&) [with T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::MatrixXd = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]'
 1607 |     bool gradient(T4 &X, Eigen::MatrixXd &y, Eigen::VectorXd &weights, Eigen::MatrixXd &beta, Eigen::VectorXd &coef0,
      |          ^~~~~~~~
api.cpp: In function 'Rcpp::List abessPCA_API(Eigen::MatrixXd, int, int, int, Eigen::VectorXd, Eigen::MatrixXd, int, int, int, bool, int, double, int, Eigen::MatrixXi, int, int, int, Eigen::VectorXi, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, int, int, Eigen::VectorXi, int, Eigen::VectorXi)':
api.cpp:264:9: warning: unused variable 'lambda_min' [-Wunused-variable]
  264 |     int lambda_min = 0, lambda_max = 0, nlambda = 100;
      |         ^~~~~~~~~~
api.cpp:264:25: warning: unused variable 'lambda_max' [-Wunused-variable]
  264 |     int lambda_min = 0, lambda_max = 0, nlambda = 100;
      |                         ^~~~~~~~~~
api.cpp:264:41: warning: unused variable 'nlambda' [-Wunused-variable]
  264 |     int lambda_min = 0, lambda_max = 0, nlambda = 100;
      |                                         ^~~~~~~
In file included from api.cpp:24:
workflow.h: In instantiation of 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
api.cpp:191:98:   required from here
workflow.h:237:12: warning: unused variable 'best_support_size' [-Wunused-variable]
  237 |     double best_support_size = parameters.sequence(min_loss_index).support_size;
      |            ^~~~~~~~~~~~~~~~~
workflow.h:242:38: warning: variable 'best_test_loss' set but not used [-Wunused-but-set-variable]
  242 |     double best_train_loss, best_ic, best_test_loss;
      |                                      ^~~~~~~~~~~~~~
workflow.h: In instantiation of 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
api.cpp:196:107:   required from here
workflow.h:237:12: warning: unused variable 'best_support_size' [-Wunused-variable]
  237 |     double best_support_size = parameters.sequence(min_loss_index).support_size;
      |            ^~~~~~~~~~~~~~~~~
workflow.h:242:38: warning: variable 'best_test_loss' set but not used [-Wunused-but-set-variable]
  242 |     double best_train_loss, best_ic, best_test_loss;
      |                                      ^~~~~~~~~~~~~~
workflow.h: In instantiation of 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
api.cpp:221:110:   required from here
workflow.h:237:12: warning: unused variable 'best_support_size' [-Wunused-variable]
  237 |     double best_support_size = parameters.sequence(min_loss_index).support_size;
      |            ^~~~~~~~~~~~~~~~~
workflow.h:242:38: warning: variable 'best_test_loss' set but not used [-Wunused-but-set-variable]
  242 |     double best_train_loss, best_ic, best_test_loss;
      |                                      ^~~~~~~~~~~~~~
workflow.h: In instantiation of 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
api.cpp:226:119:   required from here
workflow.h:237:12: warning: unused variable 'best_support_size' [-Wunused-variable]
  237 |     double best_support_size = parameters.sequence(min_loss_index).support_size;
      |            ^~~~~~~~~~~~~~~~~
workflow.h:242:38: warning: variable 'best_test_loss' set but not used [-Wunused-but-set-variable]
  242 |     double best_train_loss, best_ic, best_test_loss;
      |                                      ^~~~~~~~~~~~~~
In file included from api.cpp:20:
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:191:98:   required from here
Algorithm.h:250:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  250 |             bool success = this->primary_model_fit(train_x, train_y, train_weight, this->beta, this->coef0, DBL_MAX,
      |                  ^~~~~~~
Algorithm.h:284:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  284 |         bool success =
      |              ^~~~~~~
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:196:107:   required from here
Algorithm.h:250:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  250 |             bool success = this->primary_model_fit(train_x, train_y, train_weight, this->beta, this->coef0, DBL_MAX,
      |                  ^~~~~~~
Algorithm.h:284:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  284 |         bool success =
      |              ^~~~~~~
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:221:110:   required from here
Algorithm.h:250:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  250 |             bool success = this->primary_model_fit(train_x, train_y, train_weight, this->beta, this->coef0, DBL_MAX,
      |                  ^~~~~~~
Algorithm.h:284:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  284 |         bool success =
      |              ^~~~~~~
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:226:119:   required from here
Algorithm.h:250:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  250 |             bool success = this->primary_model_fit(train_x, train_y, train_weight, this->beta, this->coef0, DBL_MAX,
      |                  ^~~~~~~
Algorithm.h:284:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  284 |         bool success =
      |              ^~~~~~~
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::final_fitting(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
Algorithm.h:313:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:191:98:   required from here
Algorithm.h:609:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  609 |         bool success =
      |              ^~~~~~~
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::final_fitting(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
Algorithm.h:313:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:196:107:   required from here
Algorithm.h:609:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::final_fitting(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
Algorithm.h:313:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:221:110:   required from here
Algorithm.h:609:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
Algorithm.h: In instantiation of 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::final_fitting(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
Algorithm.h:313:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:226:119:   required from here
Algorithm.h:609:14: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
Algorithm.h: In instantiation of 'bool Algorithm<T1, T2, T3, T4>::splicing(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
Algorithm.h:430:39:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::get_A(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, int, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]'
Algorithm.h:307:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:191:98:   required from here
Algorithm.h:531:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
  531 |             bool success = this->primary_model_fit(X_A_exchage, y, weights, beta_A_exchange, coef0_A_exchange,
      |                  ^~~~~~~
Algorithm.h: In instantiation of 'bool Algorithm<T1, T2, T3, T4>::splicing(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
Algorithm.h:430:39:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::get_A(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, int, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]'
Algorithm.h:307:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:196:107:   required from here
Algorithm.h:531:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
Algorithm.h: In instantiation of 'bool Algorithm<T1, T2, T3, T4>::splicing(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
Algorithm.h:430:39:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::get_A(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, int, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]'
Algorithm.h:307:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:221:110:   required from here
Algorithm.h:531:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
Algorithm.h: In instantiation of 'bool Algorithm<T1, T2, T3, T4>::splicing(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
Algorithm.h:430:39:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::get_A(T4&, T1&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int&, T2&, T3&, Eigen::VectorXd&, int, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, double, double&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]'
Algorithm.h:307:15:   required from 'void Algorithm<T1, T2, T3, T4>::fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, int, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
workflow.h:218:49:   required from 'Rcpp::List abessWorkflow(T4&, T1&, int, int, int, Eigen::VectorXd, int, int, bool, int, double, int, Parameters, int, Eigen::VectorXi, bool, int, bool, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double, double, std::vector<Algorithm<T1, T2, T3, T4>*>) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Rcpp::List = Rcpp::Vector<19>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
api.cpp:226:119:   required from here
Algorithm.h:531:18: warning: unused variable 'success' [-Wunused-variable]
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'double _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::loss_function(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:85:20:   required from here
AlgorithmGLM.h:87:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
   87 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:88:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
   88 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:89:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
   89 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'void _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::sacrifice(T4&, T4&, T1&, T2&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:99:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:104:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  104 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool abessMLm<T4>::primary_model_fit(T4&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::MatrixXd = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:981:10:   required from here
AlgorithmGLM.h:987:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  987 |         int n = x.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:989:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  989 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'double _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::loss_function(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:85:20:   required from here
AlgorithmGLM.h:87:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
   87 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:88:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
   88 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:89:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
   89 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'void _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::sacrifice(T4&, T4&, T1&, T2&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:99:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:104:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  104 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'double _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::loss_function(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:85:20:   required from here
AlgorithmGLM.h:87:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
   87 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:88:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
   88 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:89:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
   89 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'void _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::sacrifice(T4&, T4&, T1&, T2&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:99:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:104:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  104 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool abessMLm<T4>::primary_model_fit(T4&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::MatrixXd&, Eigen::VectorXd&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::MatrixXd = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:981:10:   required from here
AlgorithmGLM.h:987:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  987 |         int n = x.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:989:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  989 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'double _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::loss_function(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, double) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:85:20:   required from here
AlgorithmGLM.h:87:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
   87 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:88:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
   88 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:89:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
   89 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'void _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::sacrifice(T4&, T4&, T1&, T2&, T2&, T3&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, int) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:99:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:104:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  104 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_approx_newton_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:1586:44:   required from 'bool abessGamma<T4>::primary_model_fit(T4&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, double&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:1575:10:   required from here
AlgorithmGLM.h:178:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  178 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:179:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  179 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:180:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  180 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_IRLS_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:1589:35:   required from 'bool abessGamma<T4>::primary_model_fit(T4&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, double&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:1575:10:   required from here
AlgorithmGLM.h:238:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  238 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:239:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  239 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:240:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  240 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_approx_newton_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:77:26:   required from 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::primary_model_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:71:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:178:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  178 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:179:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  179 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:180:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  180 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_IRLS_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:80:26:   required from 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::primary_model_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:71:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:238:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  238 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:239:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  239 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:240:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  240 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_approx_newton_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:1586:44:   required from 'bool abessGamma<T4>::primary_model_fit(T4&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, double&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:1575:10:   required from here
AlgorithmGLM.h:178:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  178 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:179:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  179 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:180:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  180 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_IRLS_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T3 = double; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:1589:35:   required from 'bool abessGamma<T4>::primary_model_fit(T4&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, Eigen::VectorXd&, double&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:1575:10:   required from here
AlgorithmGLM.h:238:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  238 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:239:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  239 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:240:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  240 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_approx_newton_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:77:26:   required from 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::primary_model_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:71:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:178:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  178 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:179:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  179 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:180:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  180 |         int M = y.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h: In instantiation of 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::_IRLS_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]':
AlgorithmGLM.h:80:26:   required from 'bool _abessGLM<T1, T2, T3, T4>::primary_model_fit(T4&, T1&, Eigen::VectorXd&, T2&, T3&, double, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&, Eigen::VectorXi&) [with T1 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T2 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; T3 = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; T4 = Eigen::Matrix<double, -1, -1>; Eigen::VectorXd = Eigen::Matrix<double, -1, 1>; Eigen::VectorXi = Eigen::Matrix<int, -1, 1>]'
AlgorithmGLM.h:71:18:   required from here
AlgorithmGLM.h:238:13: warning: unused variable 'n' [-Wunused-variable]
  238 |         int n = X.rows();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:239:13: warning: unused variable 'p' [-Wunused-variable]
  239 |         int p = X.cols();
      |             ^
AlgorithmGLM.h:240:13: warning: unused variable 'M' [-Wunused-variable]
  240 |         int M = y.cols();
      |             ^
g++-13 -std=gnu++17 -I"/data/gannet/ripley/R/R-devel/include" -DNDEBUG -I ../inst/include -DR_BUILD -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/Rcpp/include' -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/RcppEigen/include' -I/usr/local/include   -fopenmp  -fpic  -g -O2 -Wall -pedantic -mtune=native -Wno-ignored-attributes -Wno-parentheses -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=3 -fexceptions -fstack-protector-strong -fstack-clash-protection -fcf-protection   -c normalize.cpp -o normalize.o
g++-13 -std=gnu++17 -I"/data/gannet/ripley/R/R-devel/include" -DNDEBUG -I ../inst/include -DR_BUILD -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/Rcpp/include' -I'/data/gannet/ripley/R/test-dev/RcppEigen/include' -I/usr/local/include   -fopenmp  -fpic  -g -O2 -Wall -pedantic -mtune=native -Wno-ignored-attributes -Wno-parentheses -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=3 -fexceptions -fstack-protector-strong -fstack-clash-protection -fcf-protection   -c utilities.cpp -o utilities.o
g++-13 -std=gnu++17 -shared -L/usr/local/gcc13/lib64 -L/usr/local/lib64 -L/usr/local/clang18/lib/x86_64-unknown-linux-gnu -o abess.so RcppExports.o api.o normalize.o utilities.o -fopenmp
make[1]: Leaving directory '/data/gannet/ripley/R/packages/tests-devel/abess/src'
make[1]: Entering directory '/data/gannet/ripley/R/packages/tests-devel/abess/src'
make[1]: Leaving directory '/data/gannet/ripley/R/packages/tests-devel/abess/src'
installing to /data/gannet/ripley/R/packages/tests-devel/abess.Rcheck/00LOCK-abess/00new/abess/libs
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** checking absolute paths in shared objects and dynamic libraries
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (abess)